高效能计算平台:正在改变科研节奏的隐形底座
去年去国内Top2高校的生信实验室帮忙整理数据,差点惊掉我下巴。
之前他们砸了几十万买了两块顶级消费级GPU,一群人美滋滋觉得能通吃所有项目,结果做单细胞全基因组测序的关联分析,跑一次要整整14天,中间只要服务器断一次网,或者碰到电压波动,前功尽弃,重头再来。
直到后来学校新的公共高效能计算平台上线,他们把同样的任务交上去。你猜怎么着?三天出结果,还自动存断点,连中间的日志都给你整理得明明白白,根本不用人守着。
高校公共高效能计算集群服务器机房
我见过不少地方院所,砸了大几千万买硬件,结果因为调度逻辑烂,闲的时候大半节点空转,忙的时候所有人排队排一个月,整体资源利用率连30%都不到。这不就是赤裸裸的浪费钱吗?
说白了,现在拼算力,早就不是拼单颗芯片的性能,是拼整个平台的调度、协同、资源池化能力。高效能计算平台的核心,从来不是堆硬件,是把一堆分散的硬件,捏成一只有力的拳头。
高效能计算平台异构算力调度架构图
还有最最实用的一点,就是预置了全场景科研工具包。你知道做生信的,要装多少乱七八糟的软件吗?各种版本依赖互相打架,搞不好就能折腾你一周,啥正活都干不了。现在成熟的高效能计算平台,直接把常用的分析工具、训练框架都预装好了,版本都给你调通了,你上来直接用就行。我那个生信朋友说,就这一点,每年帮整个实验室省出至少两个月的科研时间。太香了。
不过话说回来,不是所有叫「高效能计算平台」的东西都好用。很多小机构攒的平台,就是把一堆服务器堆一块儿,装个开源调度系统就敢挂牌,其实用起来还是一堆坑,排队慢、出错多,还不如自己用工作站跑。
未来科研,高效能计算平台会变成标配
你看最近这几年,从AlphaFold预测蛋白质结构,到ChatGPT爆火带起来的大模型科研热,再到天眼快速射电暴的数据分析,哪一个离得开高效能计算?
以前只有做物理、气象、天文的才需要超算,现在呢?做生物的做化学的搞考古的,甚至搞人文的用AI复原古籍、做文献数字化,都需要大量算力支撑。前段时间我还看到有团队用高效能计算平台模拟敦煌壁画的老化过程,帮文物修复团队选保护方案,你敢信?
现在很多青年学者吐槽科研内卷,发论文难,其实很大一部分原因就是算力跟不上。你一个实验要跑半年,别人用高效能平台半个月就出结果,发论文的速度自然差好几个量级。碰到同一个方向的竞争,你有idea没算力,眼睁睁看着别人抢先发出来,多懊恼啊。
说实话,现在早就不是那个靠学者一个人抱着笔记本写代码做实验的时代了。国内这几年投了那么多超算中心、智算中心,大部分都对中小机构和青年学者开放共享,不用你自己花大几千万搭平台,花点小钱就能用上顶级的高效能计算服务,这对年轻人来说简直是天大的好事。
我认识一个青千,刚回国的时候没拿到大项目,买不起顶级算力,就靠租公共平台的算力,半年就发了两篇顶刊,评职称的时候直接过关。这放在十年前,根本想都不敢想!
当然,现在还有问题,很多老学者不会用新平台,操作逻辑太复杂,还有不同平台之间数据不互通,你在这个平台跑了一半,换个平台就得重新导数据,挺折腾。可这些都是发展中的问题,慢慢都会解决。
你随便去任何一个顶级实验室转一圈就能发现,现在大家比拼的早就不只是idea,还有你能拿到的算力工具。高效能计算平台早就不是什么高大上的摆设,它就是现在科研的水电煤。
你不用,就已经输在起跑线上了。
别再盯着单芯片算力卷了,平台才是真破局点
很多人对高效能计算的印象还停留在「堆更多芯片」「买更贵的卡」,这完全是老黄历了。 摩尔定律早就摸到天花板了,现在你花十万块买一块新旗舰GPU,算力也就比五年前的顶级卡翻个两三倍。可你看看现在科研任务的算力需求?大模型训练翻了几百倍,蛋白质结构动态模拟要的算力翻了上千倍,就连气候预测的精度提高一倍,算力需求都要涨十倍不止。 对吧?单芯片那点提升,根本追不上需求的膨胀。
高校公共高效能计算集群服务器机房
我见过不少地方院所,砸了大几千万买硬件,结果因为调度逻辑烂,闲的时候大半节点空转,忙的时候所有人排队排一个月,整体资源利用率连30%都不到。这不就是赤裸裸的浪费钱吗?
说白了,现在拼算力,早就不是拼单颗芯片的性能,是拼整个平台的调度、协同、资源池化能力。高效能计算平台的核心,从来不是堆硬件,是把一堆分散的硬件,捏成一只有力的拳头。
现在的高效能计算平台,到底强在哪?
说实话,我之前也以为就是换个名字堆机器,直到上个月跟国内做智算建设的朋友喝酒,才知道现在的平台早就玩出花了。 第一个硬货就是全异构算力调度。现在做科研,你跑序列比对要用CPU,训大模型要用GPU,做推理加速要用专用AI芯片,不同任务要吃不同的硬件。放在以前,你得自己申请不同节点,拷数据挪来挪去,折腾好几天才能开工。现在好的高效能计算平台,直接把所有资源池化了,你提交任务的时候说清楚需求,系统自动给你匹配最合适的硬件,数据不用动,直接跑,省了多少破事。 第二个就是高速互联和存算协同。现在做一次百年尺度的气候模拟,一次任务产生的数据就是几十上百TB,放在以前,数据从存储节点挪到计算节点,光传输就要大半天,一半时间都在等。现在的高效能计算平台用的是NVLink或者全域高速互联网络,延迟比普通集群低几十倍,数据传输快到你根本感觉不到在等。
高效能计算平台异构算力调度架构图
还有最最实用的一点,就是预置了全场景科研工具包。你知道做生信的,要装多少乱七八糟的软件吗?各种版本依赖互相打架,搞不好就能折腾你一周,啥正活都干不了。现在成熟的高效能计算平台,直接把常用的分析工具、训练框架都预装好了,版本都给你调通了,你上来直接用就行。我那个生信朋友说,就这一点,每年帮整个实验室省出至少两个月的科研时间。太香了。
不过话说回来,不是所有叫「高效能计算平台」的东西都好用。很多小机构攒的平台,就是把一堆服务器堆一块儿,装个开源调度系统就敢挂牌,其实用起来还是一堆坑,排队慢、出错多,还不如自己用工作站跑。
未来科研,高效能计算平台会变成标配
未来科研,高效能计算平台会变成标配
你看最近这几年,从AlphaFold预测蛋白质结构,到ChatGPT爆火带起来的大模型科研热,再到天眼快速射电暴的数据分析,哪一个离得开高效能计算?
以前只有做物理、气象、天文的才需要超算,现在呢?做生物的做化学的搞考古的,甚至搞人文的用AI复原古籍、做文献数字化,都需要大量算力支撑。前段时间我还看到有团队用高效能计算平台模拟敦煌壁画的老化过程,帮文物修复团队选保护方案,你敢信?
现在很多青年学者吐槽科研内卷,发论文难,其实很大一部分原因就是算力跟不上。你一个实验要跑半年,别人用高效能平台半个月就出结果,发论文的速度自然差好几个量级。碰到同一个方向的竞争,你有idea没算力,眼睁睁看着别人抢先发出来,多懊恼啊。
说实话,现在早就不是那个靠学者一个人抱着笔记本写代码做实验的时代了。国内这几年投了那么多超算中心、智算中心,大部分都对中小机构和青年学者开放共享,不用你自己花大几千万搭平台,花点小钱就能用上顶级的高效能计算服务,这对年轻人来说简直是天大的好事。
我认识一个青千,刚回国的时候没拿到大项目,买不起顶级算力,就靠租公共平台的算力,半年就发了两篇顶刊,评职称的时候直接过关。这放在十年前,根本想都不敢想!
当然,现在还有问题,很多老学者不会用新平台,操作逻辑太复杂,还有不同平台之间数据不互通,你在这个平台跑了一半,换个平台就得重新导数据,挺折腾。可这些都是发展中的问题,慢慢都会解决。
你随便去任何一个顶级实验室转一圈就能发现,现在大家比拼的早就不只是idea,还有你能拿到的算力工具。高效能计算平台早就不是什么高大上的摆设,它就是现在科研的水电煤。
你不用,就已经输在起跑线上了。